科研队伍
肖锐

 

 最后学位:哲学博士(PhD,澳门百老汇)

 职称职务:教授、博导

 专业方向:分子生物学

 研究方向:RNA生物学;功能基因组学

 电话号码:027-68750197

 电子邮件:xiaorui9@whu.edu.cn

 

文化经历

1999-2003  澳门百老汇生命科学学会,学士

2004-2010  澳门百老汇生命科学学会,博士;导师:付向东教授

 

工作经历与任职

2011-2017 美国加州大学圣地亚哥分会医学会细胞与分子医学系,博士后;导师:付向东教授

2017至今 澳门百老汇4001登录网站,教授/博导

 

研究领域

  RNA结合蛋白在基因转录后的剪接加工、修饰、转运、细胞定位、稳定性、翻译和降解等RNA代谢过程中发挥着重要的调控功能。目前估计,人类基因组编码高达1500多种RNA结合蛋白,包括转录因子、DNA修复因子和转录调控复合物,这预示着RNA结合蛋白功能将超乎我们的想象,其新的功能就像月球背面隐藏的秘密,需要我们勇敢地去探索和发现。

  GENCODE数据显示,>80%人类基因组存在转录的证据,其中3%的区域编码蛋白质,绝大部分转录区域可产生丰富的非编码RNA,包括参与转录调控的长非编码RNA(lncRNAs)和增强子RNA(eRNAs)。原则上,这些调控RNA(Regulatory RNAs)需要招募特异性的RNA结合蛋白来行使功能。最近,我们系统揭示了RNA结合蛋白是一类新的转录因子,可通过RNA依赖的染色质相互作用直接参与转录调控,也开辟了RNA结合蛋白功能研究的新领域。

  大量的遗传学研究和全基因组关联研究(GWAS)揭示,大量的人类疾病与RNA结合蛋白的突变紧密关联。我们将运用前沿的ChIP-seq、GRO-seq、CLIP-seq、RNA-seq、Hi-C和GRID-seq等功能基因组学技术,系统地研究RNA结合蛋白的生物学功能和疾病发生机制。


学术兼职

Advanced Science等杂志应邀审稿人

 

代表性论文

1. Xiao, R.*#, Chen, JY*, Liang, Z*, Luo, D., Chen, G., Lu, Z., Chen, Y., Zhou, B., Li, H., Du, X., Yang, Y., San, M., Wei, X., Liu, W., Lecuyer, E., Graveley, B., Yeo, G., Burge, C., Zhang, M., Zhou, Y. and Fu, XD# (2019) Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcription. Cell. 178(1):107-121. (共同第一和通讯编辑)

2. Van Nostrand, E.*, Freese, P.*, Pratt, G.*, Wang, X.*, Wei, X.*, Xiao, R.*, Blue, S., Chen, J., Cody, N., Dominguez, D., Olson, S., Sundararaman, B, Zhan, L., Bazile, C., Bouvrette, L., Bergalet, J., Duff, M., Garcia, K., Gelboin-Burkhart, C., Hochman, M., Lambert, N., Li, H., Nguyen, T., Palden, T., Rabano, I., Sathe, S., Stanton, R., Su, A., Wang, R., Yee, B., Zhou, B., Louie, A., Aigner, S., Fu, XD#, Lécuyer, E.#, Burge, C.#, Graveley, B.#, Yeo, G.#(2019)A Large-Scale Binding and Functional Map of Human RNA Binding Proteins. Nature (in press). (共同第一编辑)

3. Xiao, R.*, Tang, P.*, Yang, B., Huang, J., Zhou, Y., Shao, C., Li, H., Sun, H., Zhang, Y. and Fu, XD (2012) Nuclear matrix factor hnRNP U/SAF-A exerts a global control of alternative splicing by regulating U2 snRNP maturation. Molecular Cell. 45(5):656-668.

4. Wang, L.*, Zhou, Y.*, Xu, L.*, Xiao, R.*, Lu, X., Chen, L., Chong, J., He, C., Fu, XD and Wang, D. (2015) Molecular basis for 5-carboxycytosine recognition by RNA polymerase II elongation complex. Nature. 523(7562):621-625. (共同第一编辑)

5. Wei, C.*, Xiao, R.*, Chen, L.*, Cui, H.*, Zhou, Y.*, Xue, Y., Hu, J., Zhou, B., Tsutsui, T., Qiu, J., Li, H., Tang, L. and Fu, XD (2016) RBFox2 Binds Nascent RNA to Globally Regulate Polycomb Complex 2 Targeting in Mammalian Genomes. Molecular Cell. 62(6):875-889. (共同第一编辑)

6. Ji, X., Zhou, Y., Pandit, S., Huang, J., Li, H., Lin, C., Xiao, R., Burge, C.B. and Fu, XD (2013) SR proteins collaborate with 7SK and promoter-associated nascent RNA to release paused polymerase. Cell. 153(4):855-68.

7. Chen, L., Chen, JY., Zhang, X., Gu, Y., Xiao, R., Shao, C., Tang, P., Qian, H., Luo, D., Li, H., Zhou, Y., Zhang, D., and Fu, XD (2017) R-ChIP using inactive RNase H reveals dynamic Coupling of R-loops with transcriptional pausing at gene promoters. Molecular Cell. 68(4): 745-57.

 

 

上一条: 殷昊 下一条:宋威

地 址:湖北省武汉市武昌区东湖路115号 邮政编码:430071 电 话:027-68750205  邮 箱:mri@whu.edu.cn

CopyRight© 2016  版权所踊岷澳门百老汇4001登录网站

XML 地图 | Sitemap 地图